"а как система поймет что товар был оплачен. Ведь покупатель мог просто нажать кнопку купить paypal на сайте но не купить. Система не поймет купил он на самом деле или не купил. Наоборот значит галочку снять надо, чтобы количество обновилось, так как система не поймет оплачен был заказ или нет?" - когда покупатель оплачивает свой заказ через этот способ оплаты, то PayPal передаёт специальные данные Вашему сайту о том, что этот заказ оплачен. На основании этих данных меняется количество товара. По крайней мере, на сколько я знаю.

"Не подскажите что значит в этой оплате песочница активирована(Тестовый режим) Скрин прикрепил" - проверка работы оплаты через PayPal без фактической оплаты. Просто для тестирования. Подробнее.

"На страницу клиента поместил user orders, но заказы клиента почему то не отображаются." - работает только для зарегистрированных пользователей. В этих платных видео уроках (на английском) показано, как это можно настроить.

"Но этот пункт отсутствует- есть только опция покупка без обяз"- есть и другие варианты:

"Под зарегеным аккаунтом совершаю покупки- и в user orders ничего не приходит." - рекомендую PHP 7.2, смотрите ошибки в консоли во время всего оформления заказа и на странице списка заказов. Проверяйте логи сервера на наличие ошибок и отказов в доступе. Данные о заказах должны храниться в базе данных. В программе нужно указать корректные данных для подключения к базе данных.

"Зачем в x5 в корзине стоит опция подтверждение заказа по завершению оплаты, если x5 не узнает оплатил клиент или нет- при пользовательском коде оплаты или при paypal. " - если оплата при помощи встроенного способа, через PayPal, то узнает. Плюс, попробуйте вручную сменить статус заказа.