è perchè non viene correttamente convertita la tabella ASCII, è un problema che riguarda tutti i database, non di website ma in generale. O le correggi a mano tutte dopo o fai un sostituisci su excel, molto più veloce, di tutte le lettere accentate, con lettere normali ed apostrofo vicino. cosi : da è in e'.

in questo modo la copia sarà fedele

...!... se parli di file CSV, ...lo hai esportato/salvato in codifica UTF-8  ...?...

... è sempre bene specificare nel dettaglio l'operazione effettuata, magari allegando il file e postando il link, in modo che chi ne fosse in grado possa verificare...

.