1) Cliccando su Salva, salva il progetto nella cartella specificata in impostazioni?

Esatto.

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2) Cliccando su Salva il progetto su disco, salva SOLO il progetto su disco in una cartella che decido al momento o salva anche il progetto nella cartella specificata in impostazioni?

intendi Esporta il Sito su Disco ?

Esporta il sito su Disco , mette in una cartella e successive sottocartelle SOLO il sito finito in formato html e suoi file , esattamente come farebbe con Esporta il sito su internet. 

Quindi NON serve come backup reale del Progetto

3) Cliccando su Esporta il progetto, esporta SOLO il progetto in un file compresso in una cartella che decido al momento o salva anche il progetto nella cartella specificata in impostazioni?

Esporta il progetto su disco mette TUTTO il progetto in un file .iwzip , per poter essere recuperato/importato , ad esempio per ripristino e per importarlo su altro pc o per importarlo su versioni successive. E lo mette SOLO nel file che scegli tu...

Ti ricordo che la 12 è fuori assistenza...

Grazie mille Claudio!

Si, intendevo "Esporta il sito su disco" come seconda opzione.

Una curiosità...
cliccando su SALVA, mi salva il progetto nella cartella specificata in Impostazioni, e poi, al termine dell'operazione, si oscura lo stesso pulsante SALVA a testimoniare l'avvenuto salvataggio.

E fin qui tutto OK!

Però... se Esporto il sito su disco o Esporto il progetto, perchè al termine dell'operazione si oscura comunque il pulsante SALVA, visto che è una funzione legata SOLO al salvataggio (standard) del progetto?

...questo dovresti chiederlo ai programmatori

ma come ho detto prima...

quanlunque cosa riguardi la 12 oramai è passato...

Lo so Claudio che l'assistenza della 12 è terminata, ma qui si tratta di una cosa comune di tutte le versioni del programma (almeno credo, visto che tutte le versioni che ho avuto finora avevano le stesse modalità di salvataggio).

Comunque grazie per le info che mi hai dato