So ganz ist nicht klar, was Du wissen möchtest.

• Eine step by step Vorgehensweise findest Du hier in den Anleitungen. Zusätzlich kannst Du im Programm auf das Fragezeichen klicken oder F1 drücken, um kontextsensitive Hilfe zu erhalten.
• Name der Domain musst Du auf der Exportseite in das Feld "URL der Website" eintragen. 
• WebsiteX5 legt die Projekte in einem sogenannten "Verzeichnis der Projekte" ab. Dieses findest Du, wenn Du auf der Startseite von WebsiteX5 unten links auf Einstellungen (Zahnradsymbol) klickst. Dort kannst Du ein beliebiges Verzeichnis einstellen. Diese Startseite von WebsiteX5 erreichst Du, wenn Du in der linken Spalte auf Home (Haussymbol) klickst. Achtung: Das Projektverzeichnis enthält nicht das, was veröffentlicht wird. Zum Veröffentlichen muss mit Schritt 5 ein Export durchgeführt werden.
• WebsiteX5 lädt nicht automatisch die Website hoch, sondern Du musst im Schritt 5 "Export" die Auswahl "Export der Website ins Internet" auswählen und alle Parameter eintragen. Den Upload musst Du jedes Mal neu starten. Wenn Du mit Filezilla (ich nehme an Du meinst dieses externe FTP-Programm) hochladen willst, musst Du vorher in WebbsiteX5 in Schritt 5 den Punkt "Export auf ein Laufwerk" auswählen und durchführen und die damit erzeugten Ordner und Dateien hochladen.