Io sono con Aruba e non ho notato questo problema.

Quando noto che l'upload è lento è perché dipende dalla mia connessione

esatto...concordo con Francesco... io uso Aruba da anni, e mai avuto problemi, se non con il mio PC...

Anche io sto con Aruba e non noto problemi come da te descritti. Se a me qualche volta è andato lento era per la mia connessione, non per Aruba

anche io con Aruba con diversi siti è tutto ok, però scrivi "in effetti se scrivo file con FileZilla il problema non sussiste"

Evidentemente qualcosa come forse il firewall o l'antivirus o non so cosa impedisce (forse) al software di lavorare correttamente.

io ho notato che il trasferimento da programma è "leggermente" più lento , a volte sensibilmente più lento, specialmente in chiusura di trasferimento, rispetto ad un  FTP terzo (tipo FileZilla) ... ma certo non impiega tempi biblici come nel tuo caso @Emanuele... 

certo non è normale... 

io di solito uso 6 connessioni simultanee e va velocissimo, se diminuisco va più lento e se aumento invece a volte si impalla...