Olá Rogeria,

Pode utilizar o sistema de FTP que preferir, como filezilla ou outro programa que prefira.

Se for usar o FTP interno do WebSite X5 deve realizar os procedimentos de configuração descritos na página 195 do manual do usuário:

http://websitex5.co.uk/br/WebSiteX5_print.pdf

Com relação à porta deve inserir o número da porta de acesso no servidor com o qual
deseja estabelecer uma conexão (seu provedor de hospedagem deve te fornecer esta informação).

Caso tenha alguma consulta adicional não hesite em nos contatar.