День добрый!

Со смещением хедера после конвертации из 12-й в 13-ю столкнулись многие. Пока не лечится) Единственное, что можно - это переделать его в 13-й и продолжать работать уже в ней.

С меню у меня случилось тоже самое. Помогло очень простое действие. Я, уже в 13-й, отключил автопрокрутку меню (павающее меню), сохранил проект, а потом опять его включил и опят сохранил . Меню стало нормально отражаться и сейчас у меня больше по нему нет вопросов. Посмотреть можете http://uagk.ru/index.php

Если чем смог вам помочь, очень рад ))

С уважением, Вячеслав

Вячеслав спасибо за попытку помочь)) Готовлю параллельно уже второй сайт собранный с нуля и в новой программе. По твоему совету меню начало отображаться, но при сохранении программа вылетела и все вернулось обратно. 

Попробуйте сохранить не сразу после изменения в настройках меню, а сделав несколько иных операций, желательно на других страницах проекта. Потом только сохранить )) Должно получиться. У меня получилось ))

Попробовал Ваш метод, сохранилось. Правда теперь через 2-7 манипуляций стабильно вылет... В новой версии программы и сайта, после того как решил ширину изменить (кнопки решил скорректировать), стало вылетать регулярно. Откатился к предыдущим изменениям, сразу стало более менее нормально. Похоже у программы есть проблема с шириной проекта (завтра попробую сайт знакомого вогнать в новую версию, отпишусь как получилось).