Io ho un problema simile.... portatile e PC fisso in casa collegati in rete.

Io ho risolto mappando un disco di rete, ad esempio hai la tua cartella sul PC fisso in D:\documenti\sito1...... sito2 .... sito3 eccc, mappi il percorso D:\documenti come disco di rete P:

Ora accederai alla cartella D:\documenti semplicemente digitando P:.....se ora vuoi raggiungere la cartella del sito1 ti basta digitare P:\sito1..... e così via per gli altri.

Se anche sul portatile mappi P: con lo stesso percorso, in questo caso dovrai mappare P: con \\nomePC\documenti dopo aver dato i permessi di lettura scrittura alla cartella documenti, su entrambi i PC ti trovi lo stesso percorso mappato come disco P:  non ti resta che usare sempre il riferimento P: per i tuoi progetti e potrai utilizzarlo contemporanemente da un PC o dall'altro. Logicamente tutto quello che aggiungi al sito immgini, audio ecc lo devi sempre cercare in P: perchè così da entrambi i PC avranno sempre lo stesso percorso da cui saranno reperibili.

Con un disco portatile penso che tu lo possa fare direttamente, l'unica accortezza è che il disco USB venga agganciato su entrambi i PC con la stessa lettera