... non è mai troppo tardi...
... potrebbe esserti da spunto per iniziare a lavorare sulla nuova versione del sito, così ti impadronisci della logica e delle funzioni da adottare...
... per quanto riguarda i files sul server diverso, sarebbe la stessa cosa di quello che avviene adesso; ..se cambierai server tutti i fies a servizio li dovrai comunque uploadare nel nuovo server anche se con il progetto stesso...

 ... mi ricordo di un nostro utente, Antonio R., con un progetto con contenuti rilevanti, che aveva manifestato diversi problemi simili ai tuoi, e che dopo aver adottato pazientemente il metodo precedentemente suggerito, aveva poi risolto, e potendo in seguito gestire il sito in tutta agilità; ... per averne un'idea, anche se non responsive, ho ripescato il suo sito, > questo ...

... pensaci con calma, e se metterai in opera ti renderai conto di quanti problemi in meno avrai...
... lavora sempre con criterio, utilizzando cartelle dedicate per tutte le risorse da usare per i vari progetti e sotto-progetti, posizionate nella radice del disco interno, nominate correttamente, e nel caso di immagini, con peso e misure già adeguate o vicine allo scopo finale, prelevando le risorse esclusivamente da queste cartelle e non da posizioni remote o esterne al PC, e per files pesanti, ma anche per le immagini, quando possibile dalle opzioni disponibili, utilizzare gli URL ai  relativi files uppati in rete con client FTP di terze parti...
... nel caso ti attivassi, ... buon lavoro ...
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ciao
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